RAID 1 Array re-synchronisieren, aber wie?

Hallo.

Ich hab folgendes Szenario laufen:

Ein RAID 1 Array, mit 2 identischen 500 GB Festplatten. Das lief alles bestens,
bis ich mich entschloß auf einer Platte, welche nicht zum Raid-Verbund gehört,
mein Windows 7 neu zu Installieren. Das Problem dabei war, das ich den ersten Controller
im BIOS auf AHCI gestellt hatte, um das Windows ohne extra Treiber zu installieren.
Dann hatte ich allerdings vergessen den Controller wieder auf RAID umzustellen.

Mit anderen Worten hab ich nu nicht gemerkt, das ich eine der Raid Platten einfach so, dh.
einzeln verwendet habe. Als ichs dann gemerkt hatte, waren schon einige Daten hinzugekommen.

Jetzt habe ich wieder auf Raid gestellt, und möchte die beiden Platten wieder miteinander synchronisieren,
was sich aber als schwierig herausstellt:

Hab das Tool AMD RaidXpert installiert, und bin auf synchronisieren gegangen.
Das lief in einer Stunde, ohne Fehlermeldung durch. Also dachte ich, das es wieder passt.

Dacht ich aber nur: Nach wie vor sind einige Ordner und Dateien nicht mehr lesbar, bzw sagt Windows, das ich
entweder keine Rechte besitze den Ordner oder die Datei zu öffnen, oder aber die Daten Beschädigt sind.
Auch nachdem ich Besitzerwechsel darauf angewendet habe, sind die Daten nicht lesbar.

Was kann ich tun? Gibts da eine möglichkeit die Platten wieder 1 zu 1 zu synchronisieren?

Für Antworten wär ich sehr Dankbar.